Au-delà des scènes célèbres, la voûte recèle quelques touches plus personnelles.

Largement interprété — un autoportrait dans une peau écorchée

Dans le Jugement dernier, saint Barthélemy tient sa propre peau écorchée — son visage affaissé et déformé est largement interprété par les historiens de l'art comme un autoportrait, bien que Michel-Ange ne l'ait jamais confirmé lui-même.

FAIT — un critique envoyé en Enfer

Selon le biographe quasi contemporain Giorgio Vasari, le maître des cérémonies pontificales Biagio da Cesena critiqua la nudité du Jugement dernier — alors Michel-Ange l'y peignit en Minos, juge des enfers, avec des oreilles d'âne et un serpent. Quand Biagio se plaignit, le pape Paul III aurait plaisanté que son autorité ne s'étendait pas jusqu'en Enfer, et le portrait resta.

Inexpliqué — les ignudi

Vingt jeunes hommes nus ponctuent les scènes principales de la voûte. Les historiens de l'art débattent encore de leur signification exacte ; Michel-Ange n'a laissé aucune explication.

FAIT — aucune signature

Contrairement à sa Pietà — la seule œuvre qu'il ait jamais signée, après avoir entendu qu'on l'attribuait à tort à quelqu'un d'autre — Michel-Ange n'a jamais signé la voûte Sixtine.