Comme la Basilique est gratuite à visiter de façon indépendante, une visite uniquement des Musées a du sens si vous préférez la voir à votre propre rythme ensuite, ou si vous manquez de temps et qu'une visite combinée signifierait précipiter les deux.

La Chapelle Sixtine est incluse dans les deux cas — elle fait partie du parcours des Musées, pas de la Basilique — donc sauter la partie Basilique ne signifie pas sauter l'attraction principale de la visite, juste la marche vers la place Saint-Pierre ensuite.